En Fedora 25 y Centos7 cuando intentmos utilizar Alien para convertir un paquete de instalación .deb a .rpm es habitual que nos salte un error similar a este cuando intentamos instalar el paquete RPM convertido:
El archivo /usr/bin de la instalación de (paquete) entra en conflicto con el archivo del paquete filesystem-3.2-37.fc24.x86_64
Para solucionarlo, simplemente tenemos que editar el rpm generado y eliminar algunas de las dependencias. Para ello podemos utilizar la utilidad: rpmrebuild.
rpmrebuild -pe paquete.rpm
Esto nos abrirá un archivo en un editor de terminal como vi, lo que tenemos que hacer es buscar la sección de archivos, la cual tiene esta pinta: